Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RLBP1P12271 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RLBP1P12271 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms