Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAMC1P11047 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms