Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GLI4P10075 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI4P10075 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GLI4P10075 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GLI4P10075 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GLI4P10075 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms