Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CSF1RP07333 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms