Protein–RNA interactions for Protein: O96018

APBA3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA3O96018 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APBA3O96018 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APBA3O96018 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APBA3O96018 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APBA3O96018 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
APBA3O96018 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
APBA3O96018 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
APBA3O96018 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
APBA3O96018 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA3O96018 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APBA3O96018 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms