Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLR1AO95602 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLR1AO95602 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms