Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRPM2O94759 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TRPM2O94759 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms