Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG13O75143 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG13O75143 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ATG13O75143 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ATG13O75143 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ATG13O75143 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms