Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC39.07■■■■□ 3.85
ABCC9O60706 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ABCC9O60706 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ABCC9O60706 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms