Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCNQ3O43525 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCNQ3O43525 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
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