Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM6AO15550 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM6AO15550 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms