Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC27A2O14975 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC27A2O14975 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms