Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP17L12C9JPN9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms