Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HHLA1C9JL84 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HHLA1C9JL84 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms