Protein–RNA interactions for Protein: A6NM66

LINC01548, Uncharacterized protein encoded by LINC01548, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01548A6NM66 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01548A6NM66 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms