Protein–RNA interactions for Protein: A6NF89

OR6C6, Olfactory receptor 6C6, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR6C6A6NF89 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OR6C6A6NF89 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
OR6C6A6NF89 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms