Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GDAP2Q9NXN4 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
GDAP2Q9NXN4 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms