Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 UBBP5-201ENST00000446970 266 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ZNF525-204ENST00000491101 569 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL355075.1-201ENST00000528210 468 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AL136084.2-222ENST00000589105 885 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
BBS9Q3SYG4 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TREML3P-201ENST00000457327 501 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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