Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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RTL8BQ17RB0 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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RTL8BQ17RB0 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
RTL8BQ17RB0 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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