Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CASP12-208ENST00000448103 1071 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms