Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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NRF1Q16656 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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NRF1Q16656 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NRF1Q16656 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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