Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL078623.1-201ENST00000602702 907 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 GDPD4-201ENST00000315938 2533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC016582.1-203ENST00000433142 502 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
ECM1Q16610 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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