Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SL263P-201ENST00000467969 290 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LRP4-AS1-202ENST00000531719 731 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 HNRNPA1P74-201ENST00000560782 835 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SL131P-201ENST00000579043 256 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL078581.3-201ENST00000627304 744 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 C8orf34-AS1-201ENST00000512294 1600 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SNX18P13-201ENST00000412442 529 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC106870.2-201ENST00000421411 691 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL355490.2-201ENST00000422848 548 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPL14P5-201ENST00000436474 730 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ARL17A-203ENST00000445552 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 CDKN2AIPNLP1-201ENST00000460287 302 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
VAMP3Q15836 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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