Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TAF1AQ15573 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms