Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
SS18Q15532 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms