Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PDCD1Q15116 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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PDCD1Q15116 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 RPL26P30-201ENST00000453533 435 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PDCD1Q15116 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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