Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SMCO1Q147U7 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SMCO1Q147U7 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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