Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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TCOF1Q13428 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TCOF1Q13428 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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TCOF1Q13428 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
TCOF1Q13428 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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