Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NME3Q13232 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms