Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHAF1BQ13112 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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