Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC012485.2-201ENST00000437372 982 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 CCL23-203ENST00000615050 624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
MCCD1P59942 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms