Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ACADSBP45954 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms