Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms