Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.25
GRIK4Q16099 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GPN1-203ENST00000424214 1725 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
GRIK4Q16099 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms