Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LRRC37A4P-201ENST00000579913 3243 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC00222-203ENST00000416890 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FDFT1-208ENST00000525777 1472 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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