Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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SIX1Q15475 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SIX1Q15475 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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