Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SGCGQ13326 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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