Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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TRAF1Q13077 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TRAF1Q13077 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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