Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
GRIK2Q13002 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
GRIK2Q13002 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
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