Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC021220.1-201ENST00000507445 630 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AP005902.2-201ENST00000518393 307 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PHBP2-201ENST00000532859 806 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MAGEB10-202ENST00000614159 1389 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 IMPG1-201ENST00000369950 3558 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CTXN3-201ENST00000379445 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC012065.3-201ENST00000602736 439 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
SMTNP53814 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms