Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms