Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC083799.1-201ENST00000366451 910 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
COPS7AQ9UBW8 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms