Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTF1AQ7RTS3 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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