Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
COL24A1Q17RW2 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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COL24A1Q17RW2 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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COL24A1Q17RW2 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
COL24A1Q17RW2 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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