Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDKN3Q16667 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDKN3Q16667 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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