Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 BBOX1-201ENST00000263182 1886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NBEA-202ENST00000379922 3794 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 CCDC148-AS1-201ENST00000412781 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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CCDC85BQ15834 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PTTG3P-201ENST00000521862 606 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC01919-203ENST00000581198 598 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC025162.2-201ENST00000619602 560 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 KCNMB2-202ENST00000420517 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CCDC85BQ15834 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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