Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
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CHD4Q14839 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
CHD4Q14839 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
CHD4Q14839 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
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