Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CUL3Q13618 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CUL3Q13618 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CUL3Q13618 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CUL3Q13618 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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CUL3Q13618 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CUL3Q13618 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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