Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHAF1BQ13112 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHAF1BQ13112 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHAF1BQ13112 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHAF1BQ13112 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
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CHAF1BQ13112 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CHAF1BQ13112 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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