Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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GPS1Q13098 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
GPS1Q13098 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
GPS1Q13098 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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